Projekt využíva prístup Perturb-seq, ktorý umožňuje sledovať vplyv zapnutia alebo vypnutia
Pri práci s technológiou Perturb-seqvýskumníci robia genetické zmeny v bunkách pomocou CRISPR-Cas9 a potom používajú jednobunkové sekvenovanie RNA na zhromažďovanie informácií o RNA, ktorá je vyjadrená v dôsledku tejto genetickej zmeny. Vedci poznamenávajú, že RNA kontroluje každý aspekt správania buniek, takže táto metóda pomáha dešifrovať väčšinu bunkových účinkov minimálnych genetických zmien.
V novej štúdii vedci použilibunkové línie ľudskej rakoviny krvi, ako aj nerakovinové bunky získané zo sietnice, aby sa vykonal Perturb-seq na viac ako 2,5 miliónoch buniek. Na základe získaných údajov vytvorili genetici komplexnú mapu spájajúcu genotypy s fenotypmi.
Autori veria, že výsledky projektu pomôžubudúci výskum. Napríklad samotní tvorcovia integrovanej mapy použili údaje na štúdium bunkových účinkov génov s neznámymi funkciami, na štúdium reakcie mitochondrií na stres a na skríning génov, ktoré spôsobujú stratu alebo zisk chromozómov, čo je fenotyp, ktorý bol ťažké študovať v minulosti.
„Myslím si, že tento súbor údajov umožní všetky druhy analýz, o ktorých sme ešte ani neuvažovali, ľuďom, ktorí pochádzajú z rôznych oblastí biológie,“ hovorí Tom Norman, spoluautor štúdie.
Čítaj viac
Japonci vypustili do oceánu obrovskú turbínu, aby z prúdu získali nekonečnú energiu.
Existuje spôsob, ako zlepšiť fúziu: je to zdroj nekonečnej energie
Astronómovia z Japonska našli v galaxii neznámu štruktúru