Superpočítač odhaľuje slabé stránky HIV

Frontera pomohla vytvoriť prvé realistické modely kapsidy HIV-1, doplnené o bielkoviny, vodu a genetiku

materiál. 

Kapsidový model

"Podarilo sa nám nájsť zraniteľnosť v kapside vírusu HIV-1 pomocou rozsiahlych simulácií a analýz, ktoré sme vykonali," povedal Gregory Wath, emeritný profesor na University of Chicago.

Výskumníci použili experimentálne údaje a vyvinuli plnoatómovú simuláciu molekulárnej dynamiky kapsidy HIV-1. Simulácia pozostávala zo 100 miliónov atómov.

Výsledný obrázok ukazuje drážky, ktoré sa objavujú v procese napätia a deformácie. Môžu byť použité na pochopenie toho, kde sa proteínová mriežka zmršťuje alebo rozširuje.

Umiestnenie drážok v simulácii

Takýto výskum pomáha vytvárať lieky, ktoré fungujú podľa optimálnej stratégie a zameriavajú sa na slabé miesta vírusu. 

Čítaj viac

Všetky nádory zmizli: Nový liek na rakovinu funguje bez chemoterapie a chirurgie

Čip AI vylepšuje telefóny a notebooky: už nie je potrebné kupovať nové zariadenia

Pôvod čiernej smrti je odhalený. Výskum DNA viedol do Strednej Ázie