Алат који је развио тим зове се ЦСхапер.
То је моћан рачунарски алат који може
систематски сегментирати и анализирати ћелијске слике на нивоу конкретних представника. Ово је веома важно за проучавање деобе ћелија, као и функција ћелија и гена.Радни текст
Да би се створио рачунаруређаја, биолози су проучавали како животиње расту из једне ћелије, оплођеног јајета или кроз безбројне ћелијске деобе. Конкретно, желели су да сазнају одређене функције гена, као што су који гени су укључени у деобу ћелија да би се формирали различити органи или шта узрокује абнормалне деобе ћелија које узрокују раст тумора.&нбсп;
Да би то урадили, истраживачи су прво добилислике ћелија - њихово „породично стабло“. Затим „избијају“ (уклањају) ген из ДНК секвенце и упоређују два стабла рода да би анализирали промене у ћелијама и закључили о функцији гена. После овога, експеримент се понавља, али са другим генима.&нбсп;
Биолози су у студији користили ембрионеЦаенорхабдитис елеганс је врста црва који дели многе биолошке карактеристике са људима, тако да се може користити за проучавање раста тумора код људи.
„С обзиром да је Ц.елеганс има око 20.000 гена, што значи да би било потребно скоро 20.000 експеримената ако бисте узорковали један по један ген. Ово ће бити огромна количина података. Због тога је изузетно важно користити аутоматизовани систем за анализу слика који смо развили”,&нбсп;- текст студије.&нбсп;
Слике ћелија се обично добијају помоћускенирање ласерским зраком. Постојећи системи за анализу слике могу само успешно открити ћелијско језгро, али слика ћелијске мембране ће бити лошег квалитета, што отежава реконструкцију ћелијског облика.
Штавише, не постоји поуздан алгоритам засегментација тродимензионалних слика у временском интервалу (тј. четвородимензионалних слика) деобе ћелија. Сегментација слике је важан процес у компјутерском виду који укључује поделу визуелног уноса на сегменте како би се олакшала анализа слике. Али истраживачи морају провести стотине сати ручно означавајући многе слике ћелија.
Нови развој&нбсп;ЦСхапер може да откријећелијске мембране, генеришу ћелијске облике у 3Д простору и, што је још важније, аутоматски сегментирају ћелијске слике на нивоу ћелије.
Опширније
Опасно загревање климе започиње за 7 година
Побачај и наука: шта ће бити са децом која ће се родити
Погледајте најлепше слике Хабла. Шта је телескоп видео за 30 година?