Тим који предводе научници из Падерборна, Немачка, професор Томас Д. Куне и професор Кристијан
Научници су превазишли изазов ексаскаладок симулира САРС-ЦоВ-2 спике протеин у стварној научној рачунарској апликацији. Пробој су направили уз помоћ суперкомпјутера Перлмуттер у Националном центру за енергетска истраживања научног рачунарства (НЕРСЦ) у САД.
Перлмутер је тренутно петинајбржи рачунар на свету. Основа је била нова метода моделирања коју су Плоссл и Кухне развили последњих година и интегрисали у програм квантне хемије отвореног кода ЦП2К.
У свету рачунарства високих перформансиБрој извршених аритметичких операција двоструке прецизности (64-бита) у секунди је мерило за перформансе суперкомпјутера.
Моделирање шиљастог протеина САРС-ЦоВ-2 саКористећи 4.400 ГПУ акцелератора, научници су премашили праг екафлопса и достигли 1,1 екафлопс. Поређења ради, један корак симулације траје 42 секунде за 83 милиона атома, што значи да процес обавља приближно 47 × 10 на 18. степен операција са плутајућим зарезом. Без меморијских захтева, такав прорачун би трајао око 13 сати са првим петафлоп системом, суперкомпјутером Роадруннер 2008. године, и око 1,5 година са првим терафлоп системом, АСЦИ Ред, коришћеним 1997. године.
Опширније
Мајмунске богиње постају глобални вирус: зашто се тако брзо преносе
Нешто чудно се дешава у Универзуму: како објаснити недоследности у Хабловој константи
Дијагноза за минут: како ИТ мења здравствену заштиту