Алат за уређивање генома ТАЛЕН надмашује ЦРИСПР-Цас9 пет пута

Фрагиле Кс синдром, анемија српастих ћелија, бета таласемија и друге болести су

резултат генетских дефекатахетерохроматин. Након спровођења студије, научници су дошли до закључка да је у тако густо збијеним деловима генома алат за уређивање ТАЛЕН ефикаснији од традиционалног ЦРИСПР/Цас9. Биолози извештавају о својим налазима у часописуНатуре Цоммуницатионс.

Према Хумин Зхаоу, професору хемијских иу биомолекуларном инжењерингу са Универзитета Илиноис у Урбана-Шампаигну, који је водио нову студију, откриће потврђује да је потребан шири спектар алата за уређивање генома да би се покрили сви делови генома.

„ЦРИСПР је врло моћно средство које је револуционирало генетски инжењеринг“, објашњава Зхао. „Али и даље има одређених ограничења.“

Зхао и његове колеге користили су флуоресцентнимикроскопија са једним молекулом како би се директно посматрало како два алата за уређивање генома раде у живим ћелијама сисара. Флуоресцентни маркери омогућили су истраживачима да измеру колико је времена требало ЦРИСПР-у и ТАЛЕН-у да се крећу дуж ДНК, као и да открију и исеку циљне регионе.

„У&нбсп;утврдили смо да ЦРИСПР боље функционишеу мање рањивим регионима генома, али ТАЛЕН може приступити овим генима у хетерохроматском региону боље од ЦРИСПР-а, рекао је Зхао. „Такође смо видели да ТАЛЕН може имати већу ефикасност уређивања од ЦРИСПР-а. Може да пресече ДНК, а затим да ефикасније прави промене."

Укупно је ТАЛЕН био пет путаефикаснији од ЦРИСПР-а у више експеримената. У сваком случају, резултати ће довести до побољшаних приступа циљању различитих делова генома, Зхао закључује: „Или можемо да користимо ТАЛЕН за одређене примене, или можемо да покушамо да побољшамо перформансе ЦРИСПР-а хетерохроматином“.

Опширније

Побачај и наука: шта ће бити са децом која ће се родити

Радари су пронашли последњу тврђаву Тлингит на Аљасци. Тражили су га више од 100 година

Трећина оних који су се опоравили од ЦОВИД-19 враћа се у болницу. Сваки осми - умире

Универзитет у Илиноису на Урбана-Цхампаигн, УИУЦ- највећи од кампуса Универзитета у Илиноису. Основан 1867. Смештен у спојеним градовима Урбана и Цхампаигн у центру Илиноиса, САД.

Хетерохроматин - подручја хроматина која су у кондензованом (компактном) стању током ћелијског циклуса. Карактеристика хетерохроматинске ДНК је изузетно ниска транскрипбилност.

Ефекторске нуклеазе сличне активаторуЕфекторске нуклеазе сличне активатору транскрипције, ТАЛЕН, су рестрикцијски ензими који се могу конструисати да пресеку специфичне ДНК секвенце.

ЦРИСПР - специјални локуси бактерија и археја,који се састоје од равних понављајућих секвенци које су одвојене јединственим секвенцама. Размакнице су позајмљене од страних генетских елемената са којима се ћелија сусрела.

Цас9 (ЦРИСПР повезан протеин 9,Протеин повезан са ЦРИСПР-ом) је водећа ендонуклеаза контролисана РНК која је повезана са адаптивним имунолошким системом ЦРИСПР (Цлустеред Регуларли Интерспацед Палиндромиц Репеатс) у бројним бактеријама, посебноСтрептоцоццус пиогенес.С. пиогенескористи Цас9 да складишти, прегледа и сече страну ДНК, као што је ДНК бактериофага или плазмида.