AI ช่วยรับรู้ RNA ตกค้างของไวรัสโบราณในจีโนมของมนุษย์

การศึกษาก่อนหน้านี้ได้แสดงให้เห็นว่าเมื่อไวรัสเข้าสู่ร่างกายมนุษย์ (และสัตว์อื่น ๆ ) แล้ว

 สามารถเปลี่ยน DNA ของโฮสต์ได้โดยการเพิ่มส่วนหนึ่งอาร์เอ็นเอของตัวเอง เป็นที่ทราบกันว่าไวรัสโบราณที่ติดเชื้อในประชากรเมื่อหลายปีก่อนบางครั้งก็ทิ้ง RNA ที่เหลืออยู่ในจีโนมมนุษย์ อย่างไรก็ตาม การค้นหาพวกมันกลายเป็นงานที่ยาก เนื่องจากต้องมีการเปรียบเทียบจำนวนมากสำหรับไวรัสที่ “ต้องสงสัย” แต่ละตัว ในงานใหม่นี้ นักวิจัยใช้อัลกอริธึมการเรียนรู้ของเครื่องเพื่อแก้ไขปัญหา

ในการฝึกอัลกอริทึมนักวิทยาศาสตร์ใช้ RNA จากรู้จักองค์ประกอบของไวรัส RNA ภายนอกที่ไม่ใช่รีโทรไวรัส ด้วยการฝึกอัลกอริทึมของ RNA ของไวรัสที่ทันสมัยระบบจะรับรู้ว่ามันมีลักษณะอย่างไรโดยรวม นักวิจัยเชื่อว่าความคล้ายคลึงกันดังกล่าวอาจมีอยู่ใน RNA โบราณเช่นกัน หลังจากการฝึกอบรมนักวิทยาศาสตร์ได้ปรับแต่งระบบเพื่อป้องกันผลบวกปลอมให้ได้มากที่สุด จากนั้นพวกเขาก็นำมันไปใช้ในจีโนมของมนุษย์และพบตัวเลือกประมาณ 100 รายการเพื่อพิจารณาเพิ่มเติม หลังจากตรวจสอบแล้วนักวิจัยพบว่าหลายคนเป็นที่รู้จักแล้วและบางคนก็ต่ำกว่าเกณฑ์ที่กำหนดเป็นตัวเลือกผ่าน / ไม่ผ่าน พวกเขามีไวรัสที่ไม่รู้จักเหลืออยู่เพียงตัวเดียว

ต่อมานักวิทยาศาสตร์ตรวจสอบว่าพบเหมือนกันหรือไม่RNA ของไวรัสที่ตกค้างในจีโนมของสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ เช่นลิงและลิงชิมแปนซี การค้นพบนี้ชี้ให้เห็นว่าการติดเชื้อและการเปลี่ยนแปลงดีเอ็นเอเพิ่มเติมเกิดขึ้นอย่างน้อย 43 ล้านปีก่อน

นักวิจัยตั้งข้อสังเกตว่าข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับไวรัสโบราณและผลกระทบต่อจีโนมของมนุษย์จะช่วยให้เข้าใจถึงความแตกต่างของพฤติกรรมของไวรัสสมัยใหม่ที่ยังไม่ทราบแน่ชัด

อ่านเพิ่มเติม

การทำแท้งกับวิทยาศาสตร์: จะเกิดอะไรขึ้นกับเด็กที่จะคลอด

Radars พบป้อม Tlingit แห่งสุดท้ายในอลาสก้า พวกเขามองหาเขามานานกว่า 100 ปี

หนึ่งในสามของผู้ที่หายจาก COVID-19 กลับไปที่โรงพยาบาล ทุก ๆ แปด - ตาย