Ekip tarafından geliştirilen araca CShaper adı veriliyor.
yapabilen güçlü bir bilgi işlem aracıdır.
Hücre görüntülerini belirli temsilciler düzeyinde sistematik olarak bölümlere ayırın ve analiz edin. Bu, hücre bölünmesinin yanı sıra hücre ve gen fonksiyonlarını incelemek için çok önemlidir.Çalışma metni
Bir bilgisayar oluşturmak içinBiyologlar, bu cihazla hayvanların tek bir hücreden, döllenmiş bir yumurtadan veya sayısız hücre bölünmesi yoluyla nasıl büyüdüğünü incelediler. Özellikle, çeşitli organları oluşturmak için hücre bölünmesinde hangi genlerin rol oynadığı veya tümörlerin büyümesine neden olan anormal hücre bölünmelerine neyin sebep olduğu gibi belirli gen fonksiyonlarını bilmek istiyorlardı.
Bunu yapmak için araştırmacılar ilk olarakhücrelerin görüntüleri - onların “aile ağacı”. Daha sonra geni DNA dizisinden "çıkarırlar" (çıkarırlar) ve hücrelerdeki değişiklikleri analiz etmek ve gen fonksiyonu hakkında çıkarım yapmak için iki soy ağacını karşılaştırırlar. Bundan sonra deney başka genlerle tekrarlanır.
Biyologlar çalışmada embriyo kullandıCaenorhabditis elegans, insanlarla birçok biyolojik özelliği paylaşan bir solucan türüdür, bu nedenle insanlarda tümör büyümesini incelemek için kullanılabilir.
"Bunu dikkate alarak C.elegans'ın yaklaşık 20.000 geni vardır; bu, bir kerede bir gen numunesi almanız durumunda neredeyse 20.000 deney yapılması gerektiği anlamına gelir. Bu çok büyük miktarda veri olacak. Bu nedenle geliştirdiğimiz otomatik görüntü analiz sisteminin kullanılması son derece önemlidir.” - çalışmanın metni.
Hücre görüntüleri genellikle kullanılarak elde edilirlazer ışınıyla tarama. Mevcut görüntü analiz sistemleri, yalnızca hücre çekirdeğini başarılı bir şekilde algılayabilir, ancak hücre zarının görüntüsü kalitesiz olacaktır, bu da hücre şeklini yeniden yapılandırmayı zorlaştırır.
Üstelik güvenilir bir algoritma da yok.hücre bölünmesinin hızlandırılmış üç boyutlu görüntülerinin (yani dört boyutlu görüntülerin) segmentasyonu. Görüntü segmentasyonu, görüntü analizini kolaylaştırmak için görsel girdiyi bölümlere ayırmayı içeren bilgisayarlı görmede önemli bir süreçtir. Ancak araştırmacıların birçok hücre görüntüsünü manuel olarak etiketlemek için yüzlerce saat harcaması gerekiyor.
CShaper'ın algılayabileceği yeni gelişmeHücre zarları, 3 boyutlu alanda hücre şekilleri oluşturur ve daha da önemlisi hücre görüntülerini hücre düzeyinde otomatik olarak bölümlere ayırır.
Daha fazla oku
7 yıl sonra tehlikeli iklim ısınması başlayacak
Kürtaj ve bilim: doğum yapacak çocuklara ne olacak
Hubble'ın en güzel resimlerine göz atın. Teleskop 30 yılda ne gördü?