Yeni çalışmada yazarlar, belirli bir proteinin hangi formu alacağını belirleyen bir sinir ağı oluşturdular.
Protein şekli şimdi kullanılarak hesaplanırprotein moleküllerinin üç boyutlu fotoğraflarını veren veya yapılarını kimya ve kuantum fiziği yasalarına göre hesaplayan bir süper bilgisayar yardımıyla bir parçacık hızlandırıcı.
Yazarlar evoformer algoritmasını oluşturdular.protein moleküllerinin ayrı ayrı bölümlerinin yapısını belirlemeye çalışır ve bunları üç boyutlu bir grafik ağacı (birbirleriyle çiftler halinde bağlanan bir dizi nesneden oluşan matematiksel bir soyutlama) biçiminde temsil eder. Evoformer, halihazırda bilinen örneklere dayanarak bunları birbirine bağlar ve bağlantıların yapısını ve düğümlerin konumunu kademeli olarak değiştirerek optimuma yaklaşır.
Daha sonra, bu tür algoritmaları birleştirdiler ve bir sinir ağı AlphaFold2 oluşturdular.
Geçen yıl zaten ilk versiyonu sundukCASP13 yarışması kapsamında proteinlerin yapısını neredeyse atomik doğrulukla tahmin edebilen sistemimiz AlphaFold. Şimdi, hız ve doğruluk açısından tüm rakipleri gözle görülür şekilde geride bırakan yeni bir versiyonunu yarattık. Üstelik kaynak kodu tamamen açıktır.
Deepmind'ın CEO'su Demis Hassabis
Sonuç olarak sinir ağı, protein içindeki her atom için 0,096 nanometre hatayla yaklaşık 10 dakika içinde üç boyutlu şekli atomik hassasiyetle yeniden oluşturur.
Daha fazla oku:
Evrenin kara deliklerin yakınında nasıl yansıdığını açıkladı
Kitle zehirlenmesi ve uygarlığın ölümünün yeni versiyonları: Maya hakkındaki bilgimiz nasıl değişti?
Dünya'nın yörüngesindeki değişiklikler, gezegende karmaşık yaşamın ortaya çıkmasına katkıda bulundu.