Yazarlar, nasıl yapılacağını tahmin eden bir yazılım kullanarak mini antikorlar geliştirdiler.
Bu çok şaşırtıcı bir şey! Birçok olasılık açar.
Stephen Mayo, Caltech'te kimyager
Antikorlar proteinlere iyi bağlanır;farklı mikroplarla. Bu nedenle ilaç firmaları bunları enfeksiyonlar ve kanserle mücadelede ilaç olarak kullanıyor. Ancak antikorlar büyük proteinlerdir, dolayısıyla yapımı pahalıdır ve süreç genellikle kararsızdır. Araştırmanın yazarları bu sorunların üstesinden gelmek için çalıştılar.
Antikorların bir hedefe bağlanma süreciWashington Üniversitesi'nde (UW) bir hesaplamalı yapısal biyolog olan David Baker, dimdik bir uçuruma tırmanmaya çalışan bir kaya tırmanıcısına benziyor, diye açıklıyor. Böyle bir kayanın yüzeyi genellikle pürüzsüzdür ve kollar ve bacaklar için çok az destek vardır. Antikorlar büyüktür, bu nedenle aynı anda birçok tutuş yapabilir ve sıkıca tutunabilirler.
Ancak mini antikorların olasılığı daha azdır.Araştırmacılar bu eksikliği gidermeye çalıştılar; proteinlerdeki yakalama bölgelerini belirlediler ve buna dayanarak mini antikorlar oluşturdular. Ancak bu yalnızca iyi çalışılmış proteinler için işe yarar.
Bu sorunu aşmak için Baker ve meslektaşlarıamino asit dizilerine dayalı olarak protein yapılarını tahmin etmek için geliştirdikleri Rosetta yazılımına yöneldiler. Ekip, potansiyel dayanak noktalarının bir haritasını oluşturmak için programa, hedef proteinin yüzeyindeki çeşitli noktalara ne kadar sıkı tanımlanmış amino asitlerin bağlanacağını hesaplama görevini verdi. Araştırmacılar, on binlerce sanal mini antikor oluşturmak için Rosetta'yı kullandılar.
Bu yazılım izin verecekSan Francisco'daki California Üniversitesi'nde biyomühendis olan Tanya Kortemme, araştırmacıların hastalıkları erken aşamada tespit etmeye yardımcı olacak tanısal problar geliştirmelerini istiyor.
proteinleri tasarlayabiliriz.herhangi bir hedefle temasa geçin. Bu, mini proteinlerin yalnızca hastalığa neden olan proteinleri bloke etmekle kalmayıp, aynı zamanda ilaçları kanserli dokulara yönlendirebileceği veya herhangi bir hücreye ışık yayan veya radyoaktif tanı molekülleri iletebileceği anlamına gelir. Bu, tedavideki ilerlemenin izlenmesine yardımcı olacaktır.
Longxin Cao, UW doktora sonrası
Daha fazla oku:
“Beşinci unsur” mevcut: Yeni bir deney bilginin önemli olduğunu doğrulayacak
"James Webb" bir yıldızın tarihteki en net fotoğrafını çekti
Kuantum şarjı, elektrikli araçların rekor kıran hızlı şarj edilmesini sağlayacak