SARS-CoV-2, virüsün vücudundan çıkan kısmı olan spike proteininde mutasyonlar kazanacak şekilde evrimleşti.
Kredi: Hin Hark Gan ve Christine Gansalus, NYU Biyoloji Bölümü.
Bilim adamları, virüsün dünyanın bazı bölgelerinde hızlı yayılmasının temel nedeninin başak proteinindeki bu mutasyonlar olduğunu öne sürüyorlar.
Son aylarda yeni ve daha fazlası olduHindistan ve Brezilya gibi ülkelerde yeni salgın dalgalarına yol açan koronavirüsün bulaşıcı türleri. Kötüleşen durum, yeni bulaşıcı viral türlerin hızlı bir şekilde tahmin edilmesi için yöntemler gerektirir. Ancak yeni seçenekleri takip etmek kolay bir iş değildir; genom dizileme, örneğin tek başına SARS-CoV-2 spike proteininin yaklaşık 5.000 olası varyantı olduğunu gösterir.
Böylesine geniş bir seçenek yelpazesi için taramaBilim adamları, geleneksel deneysel yöntemler için büyük bir zorluk teşkil ettiğini belirtti. Bilgisayar simülasyonlarının avantajı, yüz mutasyonun birkaç günde kolaylıkla tahmin edilebilmesidir.
Bilim insanları hesaplamalı bir yönteme yöneldiBu, SARS-CoV-2 spike proteininin, birçok hücre tipinin yüzeyinde bulunan bir protein olan ACE2 reseptörünü konakçı hücrelere girmek için nasıl tanıdığını modelliyor. Koronavirüs spike proteinlerindeki 1.003 mutasyon kombinasyonunu değerlendirdiler; buna yol açanlar da dahil Brezilya, Güney Afrika, İngiltere ve Hindistan'da enfeksiyonlarda artış.
Seçeneklerin sistematik bir değerlendirmesi şunu göstermiştir:ACE2 reseptörüne sıkıca bağlanan sivri uçlu mutasyonlar, bağlanma arayüzünde mutasyonların iki kümesinde veya "sıcak noktalarında" meydana gelir. Yapısal olarak esnek bölgelerde bulunurlar. Bu, bağlanmayı artıran mutasyonların, ACE2 reseptörlerini tanıma yeteneğini geliştirmek için omurga yapısını etkili bir şekilde yeniden programladığı anlamına gelir.
Çalışma Moleküler Biyoloji Dergisi.
Ayrıca okuyun
USAF'ın Skyborg otonom insansız hava aracı ilk uçuşunu gerçekleştirdi
Avustralya'da büyük bir güve bulundu. Kanat açıklığı 25 cm
Bilim adamları beton evleri pillere dönüştürdü