Вчені з міждисциплінарної дослідницької групи зі стійкості до протимікробних препаратів (AMR)
Спостереження за стічними водами допомагає швидко іненав'язливо відстежувати розповсюдження COVID-19. Додаткова інформація дозволяє органам охорони здоров'я відстежувати пандемію на рівні спільнот. Зовсім недавно вірусні фрагменти SARS-CoV-2 були виявлені в житлових масивах Сінгапуру в рамках програми попереджувального нагляду за стічними водами. Ця інформація, разом з контрольним тестуванням, дозволила Міністерству охорони здоров'я країни швидко відреагувати на ситуацію.
Однак виявлення варіантів коронавируса здопомогою спостереження за стічними водами менш поширене через проблеми в існуючих технологіях. Секвенування наступного покоління для спостереження за стічними водами вимагає багато часу і коштів. Тестів також не вистачає чутливості. Міжнародна команда вчених в новому дослідженні прагнула вирішити цю проблему.
У дослідженні, опублікованому вжурналі Environmental Science & Technology Letters, вчені пояснюють інноваційний метод молекулярного виявлення заснований на аллель-специфічній RT-qPCR, який виявляє та кількісно визначає варіант B.1.1.7 (Alpha). Розроблений аналіз, протестований та підтверджений на зразках стічних вод у 19 населених пунктах США, здатний надійно виявляти та кількісно визначати низькі рівні варіанта B.1.1.7 (Alpha) з низькою перехресною реактивністю та у пропорціях варіантів аж до 1 відсотка на тлі змішаних вірусів SARS -CoV-2.
Метод, спрямований на спайковую мутації білків, які дозволяють передбачити варіант B.1.1.7 (Alpha), може бути реалізований з використанням комерційно доступних протоколів RT-qPCR.
Читати далі
Уповільнення обертання Землі викликало викид кисню на планеті
Астрономи помітили в далекому космосі незвичайні структури
Подивіться на наскальні мистецтво неандертальців, яким понад 60 тис. Років
AMR - Antimicrobial Resistance
RT-qPCR - зворотна транскрипція кількісних ПЛР.