ІІ допоміг розпізнати залишки РНК древніх вірусів в геномі людини

Попередні дослідження показали, що при попаданні вірусу в організм людини (і іншої тварини), він

 може змінювати ДНК господаря, додаючи частинусвоєї власної РНК. Також відомо, що стародавні віруси, які інфікували населення багато років тому, іноді залишали залишки своєї РНК в геномі людини. Однак їх пошук виявився складним завданням через величезну кількість порівнянь, необхідних для кожного «підозрюваного» вірусу. У новій роботі дослідники використовували алгоритм машинного навчання для вирішення задачі.

Для навчання алгоритму вчені використовували РНК звідомих неретровірусних ендогенних РНК вірусних частинок. Навчаючи алгоритм сучасної вірусної РНК, система могла б відчути, як в цілому вона виглядає. Дослідники вважають, що такі спільні риси, ймовірно, існували і в стародавній РНК. Після навчання вчені налаштували систему, щоб запобігти якнайбільше помилкових спрацьовувань. Потім вони запустили її для роботи з геномом людини і знайшли близько 100 варіантів для подальшого розгляду. Вивчивши їх, дослідники виявили, що багато хто з них вже були відомі, а деякі були нижче порогового значення, яке вони встановили в якості варіанту «пройшов / не пройшов». У них залишився тільки один можливий залишок невідомого вірусу.

Пізніше вчені перевірили, виявили такий жезалишок вірусної РНК в геномах інших видів, таких як мавпи і шимпанзе. Це відкриття припускає, що інфікування і подальша зміна ДНК відбулося принаймні 43 млн років тому.

Дослідники відзначили, що більше інформації про стародавні віруси і їх вплив на геном людини дасть уявлення про нюанси поведінки сучасних вірусів, які не відомі досі.

Читати далі

Аборти і наука: що буде з дітьми, яких народять

Радари виявили останній форт тлінкітов на Алясці. Його шукали понад 100 років

Третина перехворіли COVID-19 повертаються в лікарню. Кожен восьмий - вмирає