Вчені виявили «відбитки пальців» таємничих вірусів, які ховалися у давній групі мікробів.
Цього тижня у журналі Nature Microbiologyвийшли одразу три роботи, присвячені вірусам архей групи Asgard. Вчені досліджували геноми вірусів з геномних та метагеномних даних та вивчили їх зв'язок із найвідомішими групами вірусів. Отримані дані допомогли вченим припустити, у чому полягали функції вірусів, які заражали археї Asgard.
Примітно, що це перші дослідженнявірусів архей Асгарда; раніше нічого не було відомо. У майбутньому цей напрямок досліджень може показати, чи були віруси залучені до появи еукаріотичних клітин на Землі і яким саме чином.
Взагалі, у архей групи Asgard є багато генів,які кодують еукаріотичні білки. Також вчені вважають їх найближчими родичами еукаріотів. Проте досі дослідники не знали, чи поширюється подібність між членами групи Asgard і еукаріотами на віруси, що їх заражають.
Перша група вчених проаналізуваламетагеномні послідовності. Їх отримали із глибоководних гідротермальних відкладень. Біологи зібрали шість геномів вірусів, які вражають археї гурту Asgard. Виявилося, що вони належать чотирьом вірусам, їх назвали Fenrir (Фенрір), Sköll (Сколль), Nidhogg (Нідхегг) та Ratatoskr (Рататоск). Усі вони — істоти із скандинавської міфології.
Грунтуючись на геномних даних, біологиприпустили, що вони здатні на напівавтономні реплікації геному, репарації, епігенетичні модифікації та регулювання транскрипції. А також поєднують риси вірусів бактерій та архей.
Інша група вчених отримала повний геном археїз групи Asgard і знову зібрала геном штаму LCB_4, який вважали базальною групою типу Odinarchaeota. Біологи виявили послідовності двох вірусів, їх назвали Huginn і Muninn (Хугін і Мунін — пара воронів у скандинавській міфології, які літають по всьому світу Мідгарду і повідомляють богу Одина про те, що відбувається). Родинні їм віруси знайшли в геномах та інших прокаріотах, у тому числі архей групи Asgard.
Третя робота присвячена метагеномному складання 20нових вірусів архей групи Asgard із зразків донних відкладень. Комбінуючи філогенетичний аналіз із пошуками локусів CRISPR у метагеномних даних, дослідники розділили знайдені віруси на три групи рівня сімейств.
Зрештою дослідники змогли з'ясувати функції лише деяких генів вірусів. Функції переважної більшості генів досі невідомі.
Asgard або Asgardarchaeota - передбачуванийсуперфілум, що складається з групи архей, до якої входять Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota та Heimdallarchaeota. Схоже, що еукаріоти з'явилися всередині Asgard, в гілці Heimdallarchaeota. Це означає, що архей з групи Asgard, припускають багато біологів, найбільш близьких до предків всіх організмів, у яких є клітинні ядра. Вони могли сприяти виникненню складного життя
З результатами досліджень можна ознайомитись тут, тут і тут.
Читати далі:
Подивіться на небесний «Титанік», який працюватиме на ядерній енергії
У НАСА зрозуміли, як шукати життя на Марсі: експеримент показав, де воно може бути
Астрономи знайшли планети, які відрізняються від Землі, але придатні для життя
</ P>