Як з'являються штами
Віруси розмножуються лише усередині живої клітини, використовуючи її ресурси. Для цього їм
У світі немає загальновизнаної номенклатуриназви штамів, і назви, що використовуються, досить довільні. Як правило, вони складаються з окремих літер та цифр, які записуються після видової назви. Наприклад, один із найвідоміших штамів кишкової палички.E. coliK-12.
Вірус намагається виправити збої реплікації, але не завжди вдало. Якщо мутація дає патогену якесь життєве перевага, вона може закріпитися.
Колонії штаму бактерійYersiniaна поверхні агар-агару
На даний момент відомо, що SARS-CoV-2накопичує мутації приблизно з тією ж швидкістю, що і збудник грипу. Мутації в геномі коронавируса нового типу майже завжди виникають не через випадкових помилок під час його копіювання, як у багатьох інших вірусів, а в результаті пошкодження або неправильного редагування вже готової копії РНК вірусу.
Як знаходять нові штами COVID-19
У хворих беруть зразки слизової ірозшифровують геном збудника. Цю інформацію завантажують в загальні бази даних і порівнюють. Наприклад, в базі GISAID більше двох мільйонів геномів коронавируса з усього світу. Там є трекер, що візуалізує, який варіант в якій країні виявили.
До 16 січня Росспоживнагляд повідомив, що придумав спеціальний тест, який визначатиме британський штам. Результат він покаже через 1,5 години після того, як у людини взяли мазок.
Потрібні більш поглиблені та складніші тести,щоб сказати, який штам у хворого. Зараз [за допомогою ПЛР-тестів] можна з'ясувати, чи є в людині активний вірус — є варіант COVID-19 чи ні. Але це не означає, що взагалі не можна визначити конкретний штам, просто на це потрібно більше часу та грошей.
Олексій Аграновський, професор МДУ та доктор біологічних наук
Тому в Росії дізнатися, як багато людейзаразилися коронавірусом з певною мутацією, поки неможливо, але можна робити. вибіркові тести, щоб зрозуміти, наскільки широко штам X поширений.
На сайті CoVariants, що використовує дані GISAID, можна побачити, які мутації відрізняють геном того чи іншого варіанту. Так, у дельта-варіанту чотири значущі мутації в білку-шпильці і дві делеции.
Найнебезпечніші варіанти COVID-19
ВООЗ зарахувала до небезпечних чотири варіанти: альфа, бета, гама та дельта.
- Альфа
Штам був вперше виявлений у жовтні 2020 року під час пандемії COVID-19 у Великій Британії зі зразка, взятого в попередньому місяці.
З того часу його шанси на переважання подвоювалисякожні 6,5 днів (імовірний інтервал між поколіннями). Це корелює зі значним збільшенням частоти інфікування COVID-19 у Великій Британії.
Є деякі свідчення того, що цей варіант має на 30-70% підвищену трансмісивність, крім того, попередні дослідження передбачають підвищення летальності.
Однак у міру того, як відбувається більшемутацій, може знадобитися зміна вакцини. SARS-CoV-2 не мутує так швидко, як, наприклад, віруси грипу, і нові вакцини, які довели свою ефективність до кінця 2020 року, є типами, які за необхідності можна змінити.
Станом на кінець 2020 року органиохорони здоров'я та експерти Німеччини, Великобританії і Америки вважають, що існуючі вакцини будуть настільки ж ефективні проти штаму VOC-202012/01, як і проти попередніх штамів.
- бета
Штам був вперше виявлений у Південній Африці, про щобуло повідомлено міністерством охорони здоров'я ПАР 18 грудня 2020 року. Дослідники та офіційні особи повідомили, що поширеність цього штаму була вищою серед молодих людей без будь-яких основних захворювань, і в порівнянні з іншими штамами він частіше призводить до серйозних захворювань у цих випадках.
Вчені відзначили, що цей штам містить кілька мутацій, які дозволяють йому легше прикріплятися до клітин людини.
8 січня 2021 року Guardian повідомила, що вакцинаPfizer і BioNTech від COVID-19 показала в тестах, що включають 20 аналізів крові, що вона здатна забезпечувати захист від штаму 501.V2. Необхідні подальші дослідження, щоб встановити точну ступінь захисту.
24 лютого 2021 року компанія Модерну оголосила про початок клінічних досліджень нової версії своєї вакцини. Нова версія розроблена спеціально для боротьби з 501.V2.
- гамма
Штам був вперше виявлений в Токіо 6 січня 2021року Національним інститутом інфекційних захворювань (NIID). Новий штам був виявлений у чотирьох осіб, які прибули в Токіо зі штату Амазонас 2 січня 2021 року.
Новий штам вперше з'явився в липні і вперше буввиявлений в жовтні, але на момент публікації (грудень 2020 г.), хоча частота його значно збільшилася, його поширення все ще в основному обмежувалося столицею штату Ріо-де-Жанейро.
Нової була мутація білка-шипа K417T, що дозволяєвірусу міцніше зв'язуватися з клітинами людини, а в деяких випадках навіть уникати антитіл. До того ж, вірус сильніше вражає молодих людей і вагітних жінок, ніж оригінальний.
11 лютого 2021 глава мінохоронздоров'я Бразилії Едуардо Пазуелло повідомив про те, що даний штам в три рази заразнее «оригінального» SARS-CoV-2.
- Дельта
У жовтні 2020 року лінія B.1.617.2 вперше була виявлена в Індії. У другій половині квітня 2021 року індійський штам «дельта» потрапив в Росію.
14 червня 2021 року в Індії було виявленоваріант, що мутував B.1.617.2, який відомий як варіант AY.1 або «дельта плюс». «Дельта плюс» відрізняється наявністю в спайковому білку мутації K417N, яка здатна знижувати активність антитіл у перехворілих та вакцинованих людей.
МОЗ Індії назвало три відмінні ознаки«дельти плюс»: підвищена контагіозність, посилена здатність зв'язуватися з рецепторами клітин легень та потенційна стійкість до терапії моноклональними антитілами.
На початок липня 2021 року Всесвітня організаціяохорона здоров'я зафіксувала дельта-штам у 98 країнах як з високим, так і з низьким рівнем вакцинації населення, у багатьох країнах він стає домінантним.
За даними Російського консорціуму зсеквенированию геномів SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), дельта-штам займав трохи більше половини (52%) в зразках, отриманих в Санкт-Петербурзі в травні 2021 року, а в червні 2021 року - більше 90%.
Також до категорії загрозливих відноситься і «дельта плюс», виявлений в червні минулого року в Непалі. У нього п'ять мутацій в білку-шпильці, які роблять вірус дуже небезпечним.
За якими варіантами COVID-19 стежать вчені
У списку ВООЗ ще чотири варіанти SARS-CoV-2, які представляють інтерес, але поки немає підстав вважати їх більш небезпечними: Ця, Йота, Каппа, Лямбда.
- лямбда
Так званий «лямбда-штам» SARS-CoV-2 впершевиділили в Перу в кінці літа минулого року. Зараження новим штамом також зафіксували в Аргентині і Чилі. Згодом він поширився в Німеччині, Іспанії, США, Великобританії та ряді інших країн.
У геномі «лямбда-штаму» є набір з восьмиключових мутацій, які, імовірно, підвищують заразність вірусу. Бразильські вчені під керівництвом Прісцили Уінк з Федерального університету Ріо-Гранде-ду-Сул вперше зафіксували сліди «лямбда-варіанту» SARS-CoV-2 на території Бразилії і виявили новий різновид цієї версії вірусу. Штам «лямбда» виявлений за даними на 19 липня в 29 країнах
- йота
Штам виявили в березні минулого року в Нью-Йорку,він поширювався на 35% швидше. Якийсь час успішно конкурував з альфою, вчені припускали, що в поєднанні з мутацією E484K в білку-шпильці, що допомагає вислизати від антитіл, цей варіант буде небезпечний. ВООЗ присвоїла йому статус загрозливого. Але ці прогнози не виправдалися, і тепер за ним просто спостерігають.
Чи допоможуть вакцини проти нових штамів
Однозначної відповіді немає. Оцінити ефективність вакцин можна по-різному:
- Слідкувати, як змінюється кількість нових випадківзараження та госпіталізацій. Наприклад, у Великій Британії майже 88% дорослого населення отримало одну дозу вакцини, 67% — другу. У країні домінує дельта-варіант. За офіційною статистикою, захворюваність зросла за останній тиждень більш ніж на третину, кількість госпіталізацій – на 46,8%.
- Провести експеримент у лабораторії. Вчені створюють псевдовірус з білком-шипом, додають у його геном одну мутацію за іншою, імітуючи досліджуваний варіант. Потім змішують із сироваткою крові повністю вакцинованих і капають на клітинну лінію людини, сприйнятливу до коронавірусу. За кілька днів підраховують заражені клітини.
Читати далі:
Знайдено пояснення, як Всесвіт відбивається біля чорних дір
Массовые отравления и новые версии гибели цивилизации: как изменились наши знания о майя
ОАЕ випробували технологію штучного виклику опадів в 50-градусну спеку