Найчастіше вражає молодих: що наука знає про південноафриканському штамі COVID-19

Що таке південноафриканський штам коронавируса?

Штам 501.V2, або «Африканський штам», або «південноафриканський

штам »- штам вірусу SARS-CoV-2, що викликаєCOVID-19. Вперше цей штам був виявлений в окрузі Бухта Нельсона Мандели Східно-Капській провінції ПАР, про що повідомило міністерство охорони здоров'я ПАР 18 грудня 2020 року.

особливості штаму

  • Активно поширюється серед молодих людей

Дослідники і офіційні особи повідомили, щопоширеність цього штаму була вище серед молодих людей без будь-яких супутніх захворювань, і, в порівнянні з іншими штамами, в таких випадках він частіше призводить до серйозних захворювань.

  • Викликає небезпеку другої хвилі в країнах Африки

Міністерство охорони здоров'я Південної Африки такожвказало, що цей штам може бути рушійною силою другої хвилі пандемії COVID-19 в країні через те, що штам поширюється швидше, ніж інші більш ранні штами вірусу.

  • Велика кількість мутацій

Вчені відзначили, що цей штам міститькілька мутацій, які дозволяють йому легше прикріплятися до клітин людини через трьох мутацій в рецептор-зв'язує домені (RBD) в спайковую глікопротеїну вірусу: N501Y (амінокислота аспарагін (N) замінена на амінокислоту тирозин (Y) в позиції 501), K417N і E484K.

Дві з цих мутацій (E484K і N501Y) знаходяться в рецептор-зв'язує мотив (RBM) рецептор-зв'язуючого домену (RBD).

Мутація N501Y також була виявлена ​​в штамі202012/01, широко поширився в Великобританії. Дві інші мутації, виявлені в 501.V2 - E484K і K417N, в британському штамі відсутні. Крім того, 501.V2 не має мутації 69-70del, виявленої в іншому штамі.

виявлення

Новий штам був виявлений шляхом секвенуванняповного генома. Кілька геномних послідовностей з цієї лінії були відправлені в базу даних генетичних послідовностей GISAID, наприклад, послідовність EPI_ISL_678597.

Міжнародне поширення

23 грудня Метт Хенкок оголосив, що дві людини,які приїхали з Південної Африки до Великобританії, були інфіковані 501.V2. 28 грудня. Цей штам був виявлений у двох осіб в Швейцарії і в однієї людини в Фінляндії.

29 грудня штам був виявлений у мандрівника,приїхав з Південної Африки до Японії, і у одного міжнародного мандрівника в Квінсленді, Австралія. 30 грудня штам був виявлений в Замбії. 31 грудня він був також виявлений у Франції у пасажира, який повертався з Південної Африки.

2 січня 2021 року перший випадок зараження цимштамом був виявлений в Південній Кореї. Австрія повідомила про свій перший випадок зараження цим штамом, а також про чотири випадки зараження британським штамом 4 січня. 8 січня 2021 року Ірландія повідомила про виявлення 3 випадків захворювання цим штамом, всі з яких були пов'язані з поїздками з Південної Африки.

Нечутливість до вакцин

4 січня 2021 року газета The Telegraph повідомила,що оксфордський імунолог сер Джон Белл вважає, що новий південноафриканський штам викликає «велике питання», оскільки він може бути стійким до вакцин, тим самим руйнуючи надії і замінюючи їх страхом.

У той же день професор вакцинологии Шабір Мадхізаявив CBS News, що немає впевненості в тому, що новий штам 501.V2 зможе «обійти» захист вакциною, але він вважає, що вона «може бути менш ефективною».

Додаткові мутації в білку-шпильці в штамі 501.V2 були названі доцентом кафедри клітинної мікробіології Університету Редінга Саймоном Кларком як зухвалий неспокій фактор, оскільки вони «можуть зробити вірус менш сприйнятливим до імунної відповіді, викликаного вакциною».

Лоуренс Янг, вірусолог з Уорікського університету, також зазначив, що множинні спайковую мутації цього штаму «можуть призвести до деякого відходу від імунного захисту».

Деякі дослідження показують ускользание цього штаму від нейтралізуючого многоклонального антитіла, націленого на спайк-білок SARS-CoV-2.

Угур Сахін, виконавчий директор BioNTech,заявив, що необхідні подальші дослідження, щоб переконатися, що нинішня вакцина виробництва цієї компанії працює проти штаму 501.V2, однак, якщо вакцину доведеться підправити, компанія може зробити це приблизно за 6 тижнів.

8 січня Guardian повідомила, що вакцина Pfizer іBioNTech від COVID-19 показала в тестах, що включають 20 аналізів крові, що вона здатна забезпечувати захист від штаму 501.V2. Необхідні подальші дослідження, щоб встановити точну ступінь захисту.

Компанія Модерну планує протестувати нову версію своєї вакцини, спеціально модифіковану для захисту від штаму 501.V2, аналогічні заходи вживає компанія Novavax.

За даними клінічного дослідження вакцини Ad26.COV2.S компанії Johnson & Johnson, її ефективність на півдні Африки на 15% нижче, ніж в США (57% і 72% відповідно); різниця, ймовірно, пов'язана з поширеністю штаму 501.V2 в ПАР.

Ще одне дослідження вакцини (NVX-CoV2373 виробництва Novavax) показало ефективність в 60% (для ВІЛ-негативних учасників) в Південній Африці в порівнянні з більш ніж на 90% у Великобританії.

За даними Reuters, вакцина Pfizer лише трохи менш ефективна проти 501.V2. Компанія AstraZeneca планує адаптувати свою вакцину до даного штаму, нова вакцина повинна бути готова до осені +2021.

24 лютого 2021 року компанія Модерну оголосила про початок клінічних досліджень нової версії своєї вакцини. Нова версія розроблена спеціально для боротьби з 501.V2.

мутації штаму

Вчені виявили вісім мутацій в спайковую білку «південноафриканського» штаму. Цей білок відповідає за проникнення вірусу в клітину.

  • N501Y

Одна з цих мутацій, N501Y, також присутній в«Британському» штамі B.1.1.7 і пов'язана з посиленим зв'язуванням з людським рецептором ACE2, до якого прикріплюється SARS-CoV-2 на поверхні клітини.

  • E484K

Інша мутація, E484K, в рецептор-зв'язуєдомені вірусу (RBD), визначає підвищену стійкість 501Y.V2 до нейтрализующим антитіл, що може негативно вплинути на ефективність вакцин проти COVID-19, націлених на спайковий білок.

Спайкова мутація E484K була пов'язана з випадкомповторного зараження штамом 501.V2 SARS-CoV-2 в Бразилії, що, на думку дослідників, було першим подібним випадком повторного зараження штамом, що містить дану мутацію.

Де зараз поширений штам?

Вірус 501.V2 викликав в ПАР другу хвилю епідемії, пік якої припав на середину січня. Його виявили в Ботсвані, Замбії, Кенії і Гамбії, а також в США, Канаді, Австралії, Китаї, Ізраїлі та частини європейських країн.

Крім того, штам був виявлений на території Росії, поки в одиничних кількостях.

Читати далі

Уран отримав статус самої дивної планети в Сонячній системі. Чому?

Фізики створили аналог чорної діри і підтвердили теорію Хокінга. До чого це призведе?

Аборти і наука: що буде з дітьми, яких народять