У новій роботі автори створили нейромережу, яка визначає, яку форму набуває та чи інша білкова.
Зараз форму білка розраховують за допомогоюприскорювача частинок, який дає тривимірні фотографії білкових молекул, або за допомогою суперкомп'ютера, який прораховують їх структуру відповідно до законів хімії і квантової фізики.
Автори створили алгоритм евоформера, якийнамагається визначити структуру окремих сегментів білкових молекул, представляючи їх у вигляді тривимірного дерева графів математичної абстракції, яка складається з набору об'єктів, попарно пов'язаних один з одним. Евоформер з'єднує їх один з одним, спираючись на вже відомі приклади, і поступово змінює структуру зв'язків та розташування вузлів, наближаючись до оптимуму.
Далі вони поєднали такі алгоритми і створили нейромережу. AlphaFold2.
Минулого року ми вже представили першу версіюнашої системи AlphaFold, яка змогла з майже атомною точністю передбачати структуру білків у рамках конкурсу CASP13. Зараз ми створили нову її версію, яка помітно перевершує всіх конкурентів у швидкості та точності роботи. При цьому її вихідний код повністю відкритий.
Деміс Хасабіс, генеральний директор Deepmind
В результаті нейромережа приблизно за 10 хвилин реконструює тривимірну форму з атомною точністю з похибкою в 0,096 нанометра для кожного атома всередині білка.
Читати далі:
Знайдено пояснення, як Всесвіт відбивається біля чорних дір
Массовые отравления и новые версии гибели цивилизации: как изменились наши знания о майя
Зміни орбіти Землі сприяли виникненню складної життя на планеті