Вчені з МДУ ім. Ломоносова з'ясували відразу кілька нових механізмів, які керують зчитуваністю
Подвійна спіраль ДНК подібна до гвинта.Передбачається, що вона може одночасно ковзати і прокручуватись уздовж поверхні білків її оболонки. Нам вдалося показати, що завдяки локальним деформаціям ДНК та білків-гістонів цей процес відбувається поетапно. Спочатку прокручується одна частина ДНК, а потім наступна - свого роду гусенично-гвинтовий механізм.
Олексій Шайтан, один з авторів роботи, провідний науковий співробітник МДУ
Загальна довжина всіх молекул ДНК із хромосом людиниНаприклад, клітина намотує нитку ДНК на особливі молекулярні «котушки» з білків-гістонів. Завдяки цьому геном можна упаковати дуже компактно, але при цьому значна частина нитки ДНК виявляється захованою усередині цих структур.
Як саме відбуваються руху ДНК в нуклеосоме,до останнього часу залишалося неясним. Щоб розібратися з цим, вчені змоделювали на суперкомп'ютері «Ломоносов-2» молекулярну динаміку нуклеосом на атомному рівні на рекордно довгих для комп'ютерного моделювання часи - 15 мікросекунд. Тобто суперкомп'ютер виступив таким собі обчислювальним мікроскопом, що дозволив розглянути механізми руху ДНК в геномі.
Завдяки цьому Шайтан та його колеги простежили,як нитка ДНК від'єднується від білків, як при цьому змінюється її структура і які фактори впливають на рух ланцюжка нуклеотидів, а також повторне з'єднання з білковими котушками.
Дослідження вносить і важливий внесок в розшифровку механізмів функціонування геному.
Читати далі
Створено першу точна карта світу. Що не так з усіма іншими?
Вертоліт Ingenuity успішно злетів на Марсі
У НАСА розповіли, як вони доставлять зразки Марса на Землю