Перший індійський штам
Дельта (B.1.617.2) - це новий варіант коронавірусу SARS-CoV-2, вперше виявлений і
16 червня 2021 року «Медвісник» повідомив, що часткаіндійського штаму дельта (B.1.617 за класифікацією Pango) за останні чотири тижні склала в Росії 63,2%, про що вказано на міжнародній платформі GISAID, яка забезпечує відкритий доступ до геномних послідовностей вірусів грипу та коронавірусу та географічних даних поширення варіантів коронавірусу.
В базі проекту Бернського та БазельськогоУніверситетів Швейцарії CoVariants зазначено, що частка індійського штаму дельта із секвенованих зразків становила у Росії у другій половині травня 2021 року 66%.
За даними Російського консорціуму зсеквенування геномів SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), індійський варіант дельта займав трохи більше половини (52%) у зразках, отриманих у травні, і більше 90% у червні 2021 року.
Другий індійський штам
14 червня 2021 року в Індії було виявленомутований варіант B.1.617.2, який відомий як варіант AY.1 або дельта +. Дельта + відрізняється наявністю в спайковую білку мутації K417N, яка здатна знижувати активність антитіл у перехворілих і вакцинованих людей.
МОЗ поки не відносить її до категорії мутацій, що викликають стурбованість. «Дельтою плюс» він названий тому, що використовує вісім мутацій спайк-білка, а звичайний «дельта-вірус» - тільки шість.
Представники уряду штату повідомили, що для секвенування генома було відправлено більше зразків вірусу: планується з'ясувати, чи є новий варіант домінуючим.
Для стримування поширення коронавируса влада створила спеціальні зони і опечатали райони, де був виявлений новий варіант коронавируса.
Звідки з'явилися обидва штаму?
Варіант дельта був вперше виявлений в Індіївосени минулого року – перший геном був опублікований у міжнародній базі GISAID 7 жовтня 2020 року. Це, однак, не означає, що новий різновид SARS-CoV-2 виник у тій же країні, штам в Індії лише виявили.
Перші випадки інфікування дельта + були зареєстровані в чотирьох районах штату Махараштра в центральній частині Індії
Чим небезпечні індійські штами?
Перший індійський штам має багато мутацій.На сьогоднішній день відомо, що варіант дельта в шість разів заразніший від уханьського, британського, південноафриканського та бразильського штамів. Він викликав рекордну хвилю епідемії в Індії цієї весни і зараз поширюється у багатьох країнах, витісняючи інші штами.
За даними GISAID, лідери за кількістю відібраних зразків індійського штаму - Великобританія, США, Німеччина, Сінгапур, Канада і Росія.
Відзначається характерна для варіанта дельтамутацію P681R у районі загальної всім варіантів так званої «фуриновой вставки». Ця вставка є невеликим фрагментом S-білка, в якому перед проникненням у клітину може проходити його розрізання.
Прихильники лабораторного походження SARS-CoV-2розглядають цю вставку як один із аргументів на користь того, що вірус був штучно «покращений» дослідниками, які намагалися зробити його більш заразним для клітин людини.
Аргументація будувалася на тому, що цієї фуріновойвставки немає у найближчих родичів SARS-CoV-2, а вона при цьому полегшує розрізання S-білка і впливає на заразність (подібну ділянку, втім, зустрічається у інших коронавірусів).
Головне, що відрізняє варіант дельта від дельта+,- мутація K417N. Це мутація в гені шиповидного білка, яка веде до заміни амінокислоти лізин (К) на амінокислоту аспарагін (N) цього білка в позиції 417, яка знаходиться в так званому рецептор-зв'язувальному домені (receptor-binding domain - RBD), який відповідає за зв'язування віріона з рецепторами на поверхні клітин людини, розповів професор кафедри геноміки та біоінформатики СФУ, професор Геттінгенського університету Костянтин Крутовський.
На скільки сильно штами поширилися по Росії
- Дельта
У Росії, за даними відкритого російського консорціуму із секвенування геномів SARS-CoV-2, у травні на «Дельту» припадало трохи більше половини всіх випадків (52%), а в червні — понад 90%.
Ці дані проте були отримані за підсумкамидослідження тільки в Санкт-Петербурзі. Про зростаючий поширенні «Дельти» в Росії свідчать і дані міжнародного моніторингу порталу Nextstrain.org:
Аналітик даних Сергій Шпількин на основі данихGISAID, що вивчає геноми вірусів, порахував, що частка індійського штаму в Росії подвоюється раз в 5-6 днів. «Якщо не вжити додаткових заходів, ми будемо мати подвоєння числа хворих за ті самі 5-6 днів.
- Дельта +
Як повідомляють індійські ЗМІ, 36 зразків,містять геном "Дельта плюс", були знайдені в Англії. Інші випадки пов'язують із поїздками до Непалу, Туреччини, Малайзії та Сінгапуру. Також деякі зразки прийшли з Європи та Америки, що говорить про широку поширеність цього варіанту. Повідомлень про зараження дельта+ в Росії на даний момент не було.
Відмінності в симптомах
Індійський штам коронавірусу має зовсім іншісимптоми. У Великій Британії, де штам «Дельта» став домінуючим, хворі тепер найчастіше скаржаться на головний біль, біль у горлі, підвищену температуру та нежить.
Симптоми класичного ковіда - втрата нюху ісухий кашель - тепер зустрічаються набагато рідше, через що коронавірус легко прийняти за застуду або звичайний грип, пише The Mirror з посиланням на вчених з Королівського коледжу Лондона.
Джерелом розмов про те, що зараженняваріантом дельта призводить до дещо інших симптомів, ніж зараження іншими варіантами SARS-CoV-2, став, мабуть, Тім Спектр, співробітник Королівського коледжу в Лондоні. Слова Спектра, однак, поки не були підтверджені ні науковими публікаціями, ні навіть прес-релізом проекту щодо відстеження симптомів.
У Росспоживнагляді заявили, що при зараженніштамом «Дельта» пацієнти скаржаться на болі в животі і суглобах, нудоту і втрату апетиту і слуху. Фахівці посилаються на дані індійських лікарів: в Індії у пацієнтів часто зустрічається діарея, а висока температура, кашель і втрата нюху - рідше.
Чи працюють вакцини проти індійський штамів
Варіант дельта також здатний частково йти відприродного та вакцинного імунітету, що проявляється, наприклад, у тому, що одного щеплення для надійного захисту в його випадку виявляється недостатньо, воно настає лише після введення другої дози.
Повністю імунізовані люди як і ранішезахищені від тяжкого перебігу хвороби, хоча деякий невелике зниження ефективності (щодо появи симптомів) видно в статистиці і по таким людям.
У ВООЗ закликають дочекатися результатів більшдетальних досліджень - поки немає доказів того, що вакцини не діють. Однак російські вчені 18 червня заявили, що нові мутації коронавируса знижують ефективність вакцин, розроблених і протестованих про більш ранні штамів.
Глава компанії BioNTech Угур Сахін в квітні такожзаявляв, що впевнений в ефективності вакцини Pfizer проти індійського штаму. Однак, зазначає CNBC, на той момент у компанії не було достатніх даних про варіант дельта.
На думку індійських вчених, дельта+ ухиляється від лікування моноклональними антитілами від COVID-19. Але це ще потрібно довести.
Читати далі:
У Сонячній системі помічена найбільша комета за всю історію: це майже планета
Новий метод миттєво перетворює вуглець в графен або алмази
Знайдений недорогий спосіб позбавити центри мегаполісів від перегрівання