Ett team ledd av RNA-forskaren Anne Marie Pyle har sammanställt den mest omfattande kartan hittills
SARS-CoV-2 förlitar sig på dess unikaRNA-strukturer för att infektera människor och orsaka COVID-19-sjukdom. Men bidraget från dessa strukturer till utvecklingen av infektioner och sjukdomar underskattas ofta även av forskare, säger Pyle, forskare vid Howard Hughes Medical Institute vid Yale University.
Av alla konton, om vi bara fokuserarpå proteiner som kodas i virusets genom kommer vi att förstå hur SARS-CoV-2 fungerar. Men för dessa typer av virus kan RNA-strukturerna i genomet påverka deras förmåga att fungera i samma utsträckning som de kodade proteinerna.
Anna Marie Pyle, forskare vid Howard Hughes Medical Institute vid Yale University
Forskare kan nu börja räkna ut hurdessa strukturer hjälper viruset. Denna information kan i slutändan leda till nya behandlingar för COVID-19. Till exempel, efter att forskare har identifierat de RNA-strukturer som utför viktiga uppgifter, kommer det att vara möjligt att utveckla sätt att störa dem och förhindra infektion.
Genomet till SARS-CoV-2, som numrerar cirka 30 000 bokstäverRNA är ovanligt länge efter ett RNA-virus. Omvandling av RNA till 3D-form ger SARS-CoV-2 ytterligare en uppsättning verktyg för att kompensera för ett begränsat antal gener. "RNA-viruset gynnar mest när det gäller sitt genom," säger Pyle.
Färgad elektronisk skanningmikrofotografi av en cell (blå) kraftigt infekterad med SARS-CoV-2-viruspartiklar (röd), isolerad från ett patientprov. Foto taget på NIAID Integrated Research Facility (IRF) i Fort Detrick, Maryland.
Upphovsman: NIAID
Enligt Jeffrey Keeft, StructuralEn RNA-biolog och virolog vid University of Colorado, forskare behöver en färdplan för sitt genomiska landskap för att studera något RNA-virus, särskilt SARS-CoV-2. "Dr Pyle har skapat ett slags globalt atlas som är en utmärkt utgångspunkt för nästa omgång av mer målinriktade experiment", säger han. ”På många sätt skrapar denna studie ytan på den rikedom av RNA-strukturen som sannolikt finns i detta virus. Jag misstänker att det finns många överraskningar för oss. "
Kartläggning representerar ocksåett inledande steg mot nya läkemedel som kan rikta sig mot virusets RNA-strukturer. Resan kan dock vara lång. Sedan 2014, när hans laboratorium upptäckte en nodulär struktur som dengue- och West Nile-virus använder för att kringgå cellförsvar, har Kieft försökt hitta ett sätt att neutralisera det. Han varnar för att forskarsamhället inte är helt engagerade i att identifiera droger som stör RNA-strukturen. "Denna strategi har inte studerats eller tillämpats på samma sätt som för proteiner", säger han. Men när du hanterar ett pandemivirus som SARS-CoV-2, "försöker du allt."
Läs också
Andromedahalan närmar sig vår galax. Vi berättar varför det är viktigt
Symtom på coronavirus hos barn. Vad du bör vara uppmärksam på?
Det visade sig att den Maya-civilisationen lämnade sina städer