Vad är den "brittiska" stammen av coronavirus?
Stam 202012/01 är en stam av SARS-CoV-2-viruset som orsakar covid-19. Detta
I mitten av december började påfrestningen snabbtsprida. Detta korrelerar med en betydande ökning av antalet covid-19-infektioner i Storbritannien; denna ökning tros åtminstone delvis bero på N501Y-mutationen inom den receptorbindande domänen av spike-glykoproteinet, som binder till ACE2-receptorn i mänskliga celler.
Stammen är också anmärkningsvärd för ett stort antal mutationer jämfört med den kända SARS-CoV-2-mutationstrenden per december 2020.
Stammen är känd under flera namn. Det kallas vanligen för "den brittiska stammen av covid-19" och "den brittiska stammen av coronavirus" i regeringskommunikation och i media.
Denna stam kallades tidigare "den första stammengranskades i december 2020 (VUI - 202012/01) av Public Health England, men nedgraderades till en Strain of Concern av Meera Chand och kollegor i en rapport publicerad av Public Health England den 21 december 2020.
I en rapport skriven på uppdrag av konsortietGenomics COVID-19 UK (COG-UK) Andrew Rambeau och hans medförfattare hänvisade till denna stam som härstamning B.1.1.7. CDC kallar också denna stam 20B / 501Y.V1.
Länder med bekräftade fall av VOC-2020/12/01
Var kom han ifrån?
Tydligen från Sydafrika.Den första rapporten om denna stam publicerades av en grupp lokala biologer ledd av da Oliveira den 22 december 2020 - prover samlades in i början av oktober. Eftersom inte alla länder har övervakningsprogram för nya stammar, bevisar naturligtvis inte den allra första upptäckten i ett land att en variant har sitt ursprung på den exakta platsen där den hittades.
Egenskaper hos den "brittiska" stammen
- Genetik
Mutationer i SARS-CoV-2-viruset händer ganskaOfta: Enligt COVID-19 Genomics Consortium of Great Britain (COG-UK) har mer än 4000 mutationer hittats i spikglykoproteinet ensamt i olika stammar av detta virus.
Stam VOC-202012/01 definieras av 23 mutationer: 13 icke-synonyma mutationer, 4 deletioner och 6 synonyma mutationer (dvs. 17 mutationer förändrar proteiner och 6 gör det inte).
- Överförbarhet
Det brittiska vetenskapliga rådgivande organet NERVTAG(Advisory Group on New and Emerging Respiratory Viruses) drog slutsatsen den 18 december 2020 att de har måttlig förtroende för att VUI-202012/01 är betydligt mer överförbar än andra stammar, med data som ännu inte är tillräckliga för att dra definitiva slutsatser om den underliggande mekanismen för ökad överförbarhet.
Data som erhållits av NERVTAG visade att dettastam har en "selektionskoefficient" på 0,70 (70%), med antagande av ett generationsintervall på 6,5 dagar. Senare arbete använde det relativa antalet reproduktioner som ett mått, vilket är en indikator på urvalskoefficienten.
Baserat på något olika data fastställdes det relativa antalet reproduktioner ("multiplikativ fördel") till 1,74 (det betyder att denna stam är 74% mer överförbar).
Denna stam har blivit dominerande i London, ochi östra och sydöstra England i en till två månader. Liknande snabb tillväxt har observerats i Irland, och det verkar som att denna stam snart kommer att bli dominerande även där.
USA ska göra detsammai mars. Ökningen av SARS-CoV-2-infektioner i början av det nya året ses som ett resultat av stamens ökade överförbarhet, medan förekomsten av andra stammar minskar. Detta kräver strängare gränser för att undvika en snabb exponentiell ökning av infektioner. Överföringskontroll av denna stam ser i sin tur allt svagare ut.
Första bilden av en brittisk stam av viruset
Är vacciner effektiva mot det?
Flera COVID-19-vacciner har utvecklats tidigare.
Men allt eftersom mer händermutationer kan vaccinet behöva modifieras. SARS-CoV-2 muterar inte lika snabbt som till exempel influensavirus, och de nya vaccinerna som visade sig vara effektiva i slutet av 2020 är typer som kan modifieras vid behov.
I slutet av 2020, organhälsoexperter och experter från Tyskland, Storbritannien och Amerika tror att befintliga vacciner kommer att vara lika effektiva mot VOC-202012/01-stammen som mot de tidigare stammarna.
Den 18 december 2020 drog NERVTAG slutsatsen att "det för närvarande inte finns tillräckligt med data för att dra någon slutsats om denna stam är okänslig för vaccinantigener."
Hittills har folkhälsovårdenStorbritannien har bekräftat att det inte finns några bevis för att den nya stammen kommer att vara resistent mot Pfizer-BioNTech-vaccinet som för närvarande används i det brittiska vaccinationsprogrammet, så vaccinerade människor är fortfarande skyddade.
Vad är speciellt med den "brittiska" stammen?
I allmänhet har den "brittiska" stammen 29 mutationerjämfört med den ursprungliga Wuhan-stammen. Detta antyder att den muterar mycket snabbare än den senare, för vilken virologer har registrerat ungefär två mutationer per månad.
Dessutom finns många mutationer i proteinettaggar av den nya stammen, underlättar bindningen av viruset till värdcellernas receptorer. Därför föreslår forskare att B.1.1.7-stammen kommer att vara farligare - den kommer att ha högre virulens och eventuellt förmågan att undvika de utvecklade vaccinernas verkan.
I en ny studie bestämde författarna att användadatorsimuleringar för att förutsäga hur olika mutationer av den "brittiska" stammen kommer att påverka spridningshastigheten och infektionens svårighetsgrad, såväl som replikering och patogenes av själva viruset.
För att förklara den ovanligt höga frekvensen av mutationer som uppträder i både S-spikproteinet och den N-terminala domänen, erbjuder forskarna tre förklaringar:
- långvarig infektion med viruset hos en patient med ett försvagat immunsystem gjorde det möjligt för viruset att mutera i hög hastighet;
- adaptiva mutationer började i djurvärdar, överfördes till människor genom zoonotisk överföring och fortsatte i den mänskliga värden;
- selektivt urval som sker i virusets struktur under tryck från antikroppar.
Simuleringsresultaten visade detstabiliteten hos vätebindningar i den mutanta varianten är högre. Dess spikprotein bildar också fler bindningar med receptorn för värdceller, och dessa bindningar kvarstår under längre tid. Den beräknade överföringshastigheten för stam B.1.1.7 är 70% högre och antalet reproduktioner är 0,4 högre än för den klassiska varianten.
Faran ligger enligt författarna också iatt genom att testa standarder, omvänd transkriptionspolymeraskedjereaktion, eller RT-PCR, kanske inte känner igen den nya stammens virala RNA. Dessutom kan en mutationsförändrad stam tillåta den att undvika neutralisering av antikroppar och minska effektiviteten av vacciner.
Var distribueras den?
Nu - praktiskt taget över hela världen.Enligt den största databasen över genomer GISAID hittades de flesta av motsvarande prover i Storbritannien, Danmark, USA, Frankrike, Spanien och Irland, det finns genom även från sådana relativt välmående länder som Nya Zeeland och Singapore. Distributionskartorna kan ses här.
Med påfrestningen i Ryssland är situationen inte heltklar. Den 10 januari rapporterade Anna Popova om sin upptäckt i landet. I den största öppna internationella databasen GISAID av genomer av variant B.1.1.7. från Ryssland nr.
Läs mer
Titta på en bild på 8 biljoner pixlar av Mars
Forskare har utvecklat en ersättning för relativitetsteorin. Vad är kärnan i "alltingsteorin"?
Abort och vetenskap: vad kommer att hända med barnen som kommer att föda