Forskare från den tvärvetenskapliga forskargruppen om antimikrobiell resistens (AMR) i
Avloppsvattenövervakning hjälper till snabbt ochspårar diskret spridningen av COVID-19. Ytterligare information gör det möjligt för hälsomyndigheter att spåra pandemin på samhällsnivå. Mer nyligen har SARS-CoV-2-virusfragment hittats i bostadsområden i Singapore som en del av ett proaktivt övervakningsprogram för avloppsvatten. Denna information, tillsammans med uppföljningstestning, gjorde det möjligt för landets hälsoministerium att snabbt reagera på situationen.
Men upptäckten av varianter av coronaviruset medövervakning av avloppsvatten är mindre vanligt på grund av problem med befintlig teknik. Nästa generations sekvensering för övervakning av avloppsvatten är tidskrävande och dyr. Testerna saknar också känslighet. Ett internationellt team av forskare i en ny studie försökte hantera detta problem.
I en studie publicerad itidskrift Environmental Science & Technology Letters, forskare förklarar en innovativ molekylär detektionsmetod baserad på allelspecifik RT-qPCR som detekterar och kvantifierar B.1.1.7 (Alfa)-varianten. Den utvecklade analysen, testad och validerad på avloppsvattenprover från 19 amerikanska samhällen, kan tillförlitligt detektera och kvantifiera låga nivåer av B.1.1.7 (Alpha)-varianten med låg korsreaktivitet och variantproportioner så låga som 1 procent i blandad SARS-virus bakgrunder -CoV-2.
En metod som syftar till proteinpikemutationer som förutsäger variant B.1.1.7 (Alpha) kan implementeras med kommersiellt tillgängliga RT-qPCR-protokoll.
Läs mer
Bromsningen av jordens rotation orsakade utsläpp av syre på planeten
Astronomer upptäcker ovanliga strukturer i djupt utrymme
Se mer 60 000 år gammal Neanderthal-rockkonst
AMR - Antimikrobiell resistens
RT -qPCR - kvantitativ PCR -omvänd transkription.