Forskarna förklarade att den kemiska sammansättningen av ett protein bestämmer dess tredimensionella struktur, och det finns mer än så.
Nu ett team av forskare frånJohannes Gutenberg University Mainz (JGU) och University of California, Los Angeles, studerade dessa strukturer mer i detalj och betraktade dem i relation till knutar. Knotade proteiner kan inte bara användas för att utvärdera kvaliteten på strukturförutsägelser, utan också väcker viktiga frågor om mekanismerna för proteinveckning och evolution.
ett av de genererade proteinerna
De studerade över 100 000genererade nya proteinnoder. Deras mål var att identifiera sällsynta högkvalitativa strukturer som innehåller komplexa och tidigare okända proteinknutar för att ge en grund för experimentell testning av AlphaFold-förutsägelser. Under studien hittade de det mest komplexa knutproteinet i forskningens historia.
”Nya upptäckter gör det också möjligt att förståevolutionära mekanismer som ligger till grund för sådana sällsynta proteiner, säger Robert Rankel, en teoretisk fysiker som också deltog i projektet. Resultaten av studien dök upp i tidskriften Protein Science.
"Vi har redan etablerat samarbete med Kalifornienuniversitet för att experimentellt bekräfta dessa strukturer. Den här forskningslinjen kommer att forma biofysiksamhällets förståelse om artificiell intelligens”, tillade forskarna.
Läs mer:
James Webb-teleskopet tog den första bilden av Jupiter: den visar 9 rörliga mål samtidigt
Forskare förstår varför T-Rex och andra stora dinosaurier hade små "händer"
Det äldsta Voyager 1-uppdraget har ett konstigt fel som inte går att fixa