Forskare har upptäckt fingeravtrycken av mystiska virus som gömde sig i en uråldrig grupp av mikrober.
Denna vecka i tidskriften Nature Microbiologytre artiklar ägnade åt virus från Asgard-gruppens arkéer publicerades på en gång. Forskare har undersökt genomen av virus från genomiska och metagenomiska data och studerat deras förhållande till de mest kända grupperna av virus. De erhållna uppgifterna hjälpte forskare att gissa exakt vad var funktionerna hos de virus som infekterade Asgard archaea.
Noterbart är att detta är den första studienarkeala Asgard-virus; ingenting var känt tidigare. I framtiden kan denna forskningslinje visa om och hur virus var involverade i uppkomsten av eukaryota celler på jorden.
I allmänhet har archaea av Asgard-gruppen många genersom kodar för eukaryota proteiner. Forskare anser också att de är de närmaste släktingarna till eukaryoter. Men hittills visste forskarna inte om likheterna mellan medlemmar i Asgard-gruppen och eukaryoter sträckte sig till virus som infekterar dem.
Den första gruppen av forskare analyserademetagenomiska sekvenser. De erhölls från hydrotermiska djuphavsavlagringar. Biologer har samlat sex genom av virus som infekterar arkéerna i Asgard-gruppen. Det visade sig att de tillhör fyra virus, de hette Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) och Ratatoskr (Ratatoskr). Alla är varelser från skandinavisk mytologi.
Baserat på genomiska data, biologerföreslog att de är kapabla till semi-autonom genomreplikation, reparation, epigenetisk modifiering och transkriptionell reglering. De kombinerar också egenskaper hos bakteriella och arkeala virus.
En annan grupp forskare har erhållit hela genomet av en arkeafrån Asgard-gruppen och återmonterade genomet av stammen LCB_4, som ansågs vara en basalgrupp av phylum Odinarchaeota. Biologer har upptäckt sekvenserna av två virus, de fick namnet Huginn och Muninn (Hugin och Munin är ett par korpar i skandinavisk mytologi som flyger runt i Midgards värld och rapporterar till guden Oden om vad som händer). Virus relaterade till dem hittades i genomen hos andra prokaryoter, inklusive arkéerna i Asgard-gruppen.
Det tredje verket ägnas åt metagenomisk montering 20nya arkeala virus från Asgard-gruppen från sedimentprover. Genom att kombinera fylogenetisk analys med sökningar efter CRISPR-loci i metagenomiska data, delade forskarna in virusen som hittats i tre grupper på familjenivå.
I slutändan kunde forskarna ta reda på funktionerna hos endast några av virusgenerna. Funktionerna hos de allra flesta gener är fortfarande okända.
Asgard eller Asgardarchaeota - förmodaten superphylum bestående av en grupp arkéer som inkluderar Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota och Heimdallarchaeota. Det verkar som om eukaryoter har sitt ursprung i Asgard, i grenen som innehåller Heimdallarchaeota. Det betyder att arkéer från Asgard-gruppen, menar många biologer, är närmast förfäderna till alla organismer som har cellkärnor. De kunde ha bidragit till uppkomsten av komplext liv
Forskningsresultaten finns här, här och här.
Läs mer:
Titta på den himmelska "Titanic" som kommer att drivas på kärnkraft
NASA kom på hur man letar efter liv på Mars: experimentet visade var det kunde vara
Astronomer har hittat planeter som skiljer sig från jorden, men som är lämpliga för liv
</ p>