CERN är världens största kärnenergilaboratorium, beläget på gränsen mellan Frankrike och Schweiz.
Fram till mars 2019 använde organisationenMicrosoft-produkter och programvara med en reducerad kurs på "akademisk institution". Men efter att tekniskt företag har avbrutit CERNs akademiska status har kostnaden för tariffen mer än fördubblats, sade facket.
Som svar tillkännagav CERN lanseringen av ett projekt för attutvecklar sin egen programvara med öppen källkod som heter Microsoft Alternatives, eller MAlt. Målet med projektet är att bryta föreningens beroende av kommersiella leverantörer, säger CERN i ett uttalande.
Den första produkten MALt kommer att vara en e-postklienttestning som hålls sommaren 2019. Om tjänsten fungerar utan fel kommer alla CERN-anställda att byta till den nya e-postklienten. Organisationen planerar också att överföra anställda från Skype for Business till en smartphone med eget operativsystem.
Tidigare rapporterades att CERN kommer att genomföra det första fullfjädrade experimentet 2021 för att söka efter mörka materialpartiklar - mörka fotoner.