Neurala nätverk utbildade för att leta efter vänsterhänt DNA

Tidigare trodde forskare att alla DNA-molekyler är helixar vridna åt höger, men efter

Efter att genomet analyserats visade det sig att så inte alltid är fallet. 

Vissa delar av kromosomerna är vridna åt vänsterkallas Z-DNA, och de som är vridna åt höger kallas B-DNA. Att förstå åt vilket håll kromosomerna vrids är viktigt eftersom det kan orsaka sjukdomar som cancer, diabetes och Alzheimers sjukdom.

Men inom diagnostik finns spiralformersvårigheter: forskare har ännu inte en korrekt uppfattning om hur ofta sådana segment förekommer inuti kromosomerna, vad som styr deras bildning och hur deras struktur kan förändras över tiden. Detta beror på både den stora storleken på genomet och svårigheterna att söka efter Z-DNA-regioner.

För att förenkla denna uppgift, ryskabioinformatik. För att träna den använde de information om redan kända genregioner, samt data om hur genaktivitet och proteinsyntes i celler regleras.

Den mest effektiva modellen baserad på denna typForskare har använt neurala nätverk för att förutsäga var ännu okända delar av Z-DNA kan finnas i det mänskliga genomet. Bioinformatik hoppas att de inom en snar framtid kommer att kunna testa förutsägelserna och använda sådana data för att studera den roll som Z-DNA spelar i kroppen.

Läs också:

Namngivna en växt som inte är rädd för klimatförändringar. Det matar en miljard människor

En bärbar sensor signalerar att en person har COVID-19

Jorden är i färd med den sjätte utrotningen. Hur kommer detta att påverka mänskligheten?