Ny programvara hittar antibiotikaresistenta bakterier som infekterar människor och djur

I en ny studie undersökte ett team av experter en stor kommersiell fjäderfäfarm i Kina och samlade in 154

prov från djur, kadaver, arbetare, deras husdjurgårdar och miljön. Från proverna isolerade de specifika bakterier Escherichia coli (E. coli). De kan leva helt ofarligt i människans tarm, men kan också vara patogena. Och om deras arvsmassa bär gener för resistens mot vissa läkemedel kan detta leda till utvecklingen av allvarliga sjukdomar, inklusive svåra magkramper, diarré och kräkningar.

Forskarna använde en beräkningsmetodsom kombinerar maskininlärning, helgenomsekvensering, gendelningsnätverk och mobila genetiska element för att karakterisera de olika typerna av patogener som finns på en gård. De fann att antimikrobiella gener (gener som ger resistens mot antibiotika) finns i både patogena och icke-patogena bakterier.

Ett nytt tillvägagångssätt med hjälp av maskininlärningtillät experter att avslöja hela nätverket av gener som är associerade med antimikrobiell resistens som är vanligt för djur, lantarbetare och miljön. Noterbart inkluderade detta nätverk gener som är kända för att orsaka antibiotikaresistens såväl som ännu okända gener associerade med läkemedelsresistens.

Byggda miljöer som områdenintensiv boskapsproduktion anses vara idealiska grogrunder för antimikrobiella resistenta bakterier och antibiotikaresistensgener. Deras studie är av stor betydelse för effektiv behandling av vissa sjukdomar och infektioner.

Läs mer

Den har jagats i århundraden: vad vet vi om planeten Vulcan bredvid solen

Fysiker har experimentellt bekräftat en ny grundläggande lag för vätskor

Astronomer har hittat källan till mystiska radioskurar som kommer från rymden