Forskning publicerad iNaturkommunikation, visade att nästa generations plattform
”Snabb och korrekt identifiering av positivaprovtagning är avgörande i kampen mot denna pandemi, säger Dr. Jeff Vrana, seniorforskare vid LTRI och professor vid institutionen för molekylär genetik vid University of Toronto. - Nya och potentiellt farliga varianter av coronavirus cirkulerar för närvarande. Den nya skalbara och automatiserade plattformen kan analysera tusentals COVID-19-patientprover i en enda körning. ”
Projektet involverade ett team av praktikanter somflyttade från andra forskningsområden för att hjälpa till att utveckla och validera plattformen. Detta gjorde att teamet kunde gå från koncept till publicerad artikel på mindre än 12 månader.
Javier Hernandez i detta odaterade arkivfoto vid Wrana-labbet vid Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute i Toronto, Kanada. Kredit: Sinai Health.
I slutet av 2020 bestämde laget igenanvänd en robotplattform för att screena tusentals positiva prover för varianter genom att snabbt sekvensera sektioner av virusgenomet med fingeravtryck för att leta efter nyckelmutationer.
Det nya SPAR-Seq-systemet är banbrytandeteknik och förmågan att sekvensera prover i realtid har enorm potential att påverka forskarnas förståelse av epidemiologi och spridningen av nya koronavirusmutationer.
Plattformen är också ekonomisk. Studien noterar att när du kör tusentals prover samtidigt är kostnaden för ett enda test bara cirka $ 8.
Läs mer
Fysiker har skapat en analog av ett svart hål och bekräftat Hawkings teori. Vart leder det?
Abort och vetenskap: vad kommer att hända med barnen som kommer att föda
En kärnkraftsmotor byggs för flygningar till Mars. Hur är det farligt?
Sinai Health System är ett sjukhussystem,som betjänar Toronto, Ontario, Kanada. Det har två sjukhus, Mount Sinai Hospital och Bridgepoint Active Healthcare, båda ägs av University of Toronto School of Medicine.