Projektet använder Perturb-seq-metoden, som låter dig spåra effekten av att slå på eller av
När du arbetar med Perturb-seq-teknikforskare gör genetiska förändringar i celler med hjälp av CRISPR-Cas9 och använder sedan encellig RNA-sekvensering för att samla information om RNA som uttrycks som ett resultat av den genetiska förändringen. Forskarna noterar att RNA kontrollerar varje aspekt av cellbeteende, så denna metod hjälper till att dechiffrera de flesta av de cellulära effekterna av minimala genetiska förändringar.
I en ny studie använde forskarehumana blodcancercellinjer, såväl som näthinnehärledda icke-cancerceller, för att utföra Perturb-seq på mer än 2,5 miljoner celler. Baserat på de erhållna uppgifterna byggde genetiker en omfattande karta som länkade genotyper med fenotyper.
Författarna tror att resultaten av projektet kommer att hjälpaframtida forskning. Till exempel använde skaparna av den integrerade kartan själva data för att studera de cellulära effekterna av gener med okända funktioner, för att studera mitokondriers reaktion på stress och för att screena för gener som orsakar kromosomförlust eller förstärkning, en fenotyp som har varit svårt att studera tidigare.
"Jag tror att denna datauppsättning kommer att tillåta alla typer av analyser som vi inte ens har tänkt på ännu, för människor som kommer från olika områden inom biologin", säger Tom Norman, medförfattare till studien.
Läs mer
Japanerna dumpade en gigantisk turbin i havet för att få oändlig energi från strömmen.
Det finns ett sätt att förbättra fusion: det är en källa till oändlig energi
Astronomer från Japan har hittat en okänd struktur i galaxen